MedRAX: 利用多模态大模型进行胸部X光片分析的智能体

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Introducción general

MedRAX是一个专为胸部X光片(CXR)分析设计的先进AI智能体。它集成了最先进的CXR分析工具和多模态大语言模型,能够动态处理复杂的医学查询,而无需额外训练。MedRAX通过其模块化设计和强大的技术基础,提供了一个统一的框架,显著提升了自动化CXR解读系统的实用性和性能。该平台还引入了ChestAgentBench,一个包含2500个复杂医学查询的综合基准,用于评估其能力。

MedRAX: 利用多模态大模型进行胸部X光片分析的智能体

 

Lista de funciones

  • 视觉问答:利用CheXagent和LLaVA-Med进行复杂的视觉理解和医学推理。
  • 图像分割:使用MedSAM和PSPNet模型进行精确的解剖结构识别。
  • 定位:通过Maira-2定位医学图像中的特定发现。
  • 报告生成:使用SwinV2 Transformer生成详细的医学报告。
  • 疾病分类:利用DenseNet-121检测18种病理类别。
  • X光片生成:使用RoentGen生成合成CXR。
  • 实用工具:包括DICOM处理、可视化工具和自定义绘图功能。

 

Utilizar la ayuda

先决条件

  • Python 3.8+
  • CUDA/GPU(最佳性能)

安装步骤

  1. almacén de clones:在终端中运行以下命令:
    git clone https://github.com/bowang-lab/MedRAX.git
    cd MedRAX
    
  2. 安装包:运行以下命令安装依赖:
    pip install -e .
    

Normas de uso

  1. 启动Gradio界面:运行以下命令启动Gradio界面:
    python main.py
    

    如果遇到权限问题,可以使用以下命令:

    sudo -E env "PATH=$PATH" python main.py
    
  2. 设置模型目录: enmain.py中设置model_dir为你希望下载或已经拥有的工具权重目录。注释掉你没有访问权限的工具。
  3. 配置API密钥:确保在.env文件中设置你的OpenAI API密钥。

Normas de uso

  1. 启动界面: Ejecutarpython main.py启动Gradio界面。
  2. 加载数据:通过界面上传胸部X光片图像。
  3. 选择功能:在界面中选择所需的分析功能,如视觉问答、图像分割等。
  4. 查看结果:分析结果将显示在界面中,包括详细的医学报告和图像标注。

Funcionamiento detallado

  • 视觉问答:上传CXR图像后,输入相关医学问题,系统将利用CheXagent和LLaVA-Med进行推理并返回答案。
  • 图像分割:选择图像分割功能,系统将使用MedSAM和PSPNet模型对图像进行解剖结构识别,并在图像上标注结果。
  • 定位:使用定位功能,系统将通过Maira-2在图像中标注特定的医学发现。
  • 报告生成:选择报告生成功能,系统将使用SwinV2 Transformer生成详细的医学报告,包括诊断结果和建议。
  • 疾病分类:上传CXR图像后,选择疾病分类功能,系统将利用DenseNet-121模型检测图像中的病理类别,并返回分类结果。
  • X光片生成:选择X光片生成功能,系统将使用RoentGen生成合成的CXR图像,供进一步分析和研究使用。
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